Chiếm ưu thế tại khu bảo tồn Mara là quần thể lớn các loài linh dương đầu bò, linh dương sừng móc, linh dương Thomson, ngựa vằn khi chúng di cư từ đồng bằng Serengeti tới phía nam và đồng bằng Loita trên các trang trại mục vụ tới phía đông nam từ tháng 7-10 hoặc sau đó. Nhiều đàn trong số chúng cũng sinh sống luôn tại khu bảo tồn.

Tất cả các loài thuộc năm loài thú săn lớn (sư tử, báo, voi, trâu rừng và tê giác) đều được tìm thấy tại đây.[2] Số lượng tê giác đen khá nhiều cho đến năm 1960, nhưng nó đã bị suy giảm nghiêm trọng do nạn săn trộm vào những năm 1970 và đầu những năm 1980, giảm xuống mức thấp nhất là 15 cá thể. Con số đã tăng chậm, nhưng ước tỉnh năm 1999 mới chỉ có 23 cá thể loài này.[3]

Hà mã và Cá sấu sông Nin được tìm thấy từng nhóm lớn ở sông Ma-na và Talek. Linh cẩu đốm, báo săn Đông Phi, chó rừng và cáo tai dơi cũng có thể được tìm thấy trong khu bảo tồn.[4] Các đồng bằng giữa sông Mara và vách đá Esoit Siria có lẽ là khu vực tốt nhất để xem các loài động vật săn mồi, đặc biệt là của sư tử và báo đốm.